为更好服务由习总书记亲自谋划、亲自部署、亲自推动的长三角一体化发展重大国家战略，2020年5月上海市委市政府决定，在整合长江联合集团等存量资源的基础之上成立一家直接由市国资委出资监管的国有独资企业——长三角投资（上海）有限公司，为市属功能保障类企业，是上海国资国企发挥服务国家战略主力军作用的重要抓手，也是探索区域共商共投共享新模式的重要平台。公司于2020年7月1日注册成立，注册资金50亿元。
公司以服务长三角一体化发展为主责主业，以示范区为发展起步的主战场、主阵地，努力打造专注于服务长三角高质量一体化发展的投资和投资服务，成为上海市国资国企对接苏浙皖的合作平台、联合走出去的服务平台、参与示范区开发建设的实施平台，成为跨区域重大项目的投资建设者、产融合作投资的价值创造者、特色产业园区的开发运营者。
公司系首家总部入驻长三角一体化示范区的上海市属国企。
